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Développer des logiciels biologiques ou aider
les biologistes à en développer est
une des raisons d'être du SIS. Dans le déroulement
chronologique des choses l'urgence a donné la
priorité à l'installation des infrastructures de
système et réseau, aussi le développement est-il
une activité d'une importance encore insuffisante.
Mais les premiers résultats existent. Il convient
de noter que le développement de certains des
logiciels énumérés ci-dessous a commencé
avant que leur auteur ne rejoigne l'Institut
Pasteur.
- Satellites est un logiciel de recherche
de satellites écrit par Gene Myers et
Marie-France Sagot
(voir chapitre 6) ;
- CDS est un logiciel de recherche de régions
codantes écrit par Frédéric Chauveau ;
- Flinqs est un logiciel de recherche de « linkers
In Query Sequence » écrit par Nicolas Joly ;
- Html4blast est un logiciel d'analyse et de présentation
des résultats de Blast écrit par Nicolas Joly ;
- Pise est un logiciel de génération d'interfaces Web pour
les logiciels biologiques écrit par Catherine Letondal ;
- VeryfastDNAml est une version de fastDNAml
parallélisée avec le paquetage TreadMarks de l'université
Rice, écrite par Denis Beaumont pendant un stage au SIS.
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