Site WWW de Laurent Bloch
Slogan du site

ISSN 2271-3905
Cliquez ici si vous voulez visiter mon autre site, orienté vers des sujets moins techniques.

Pour recevoir (au plus une fois par semaine) les nouveautés de ce site, indiquez ici votre adresse électronique :

Bioinformatique, algorithmique

Cette rubrique regroupe essentiellement des documents liés à mes activités d’enseignement et aux réflexions qu’elles suscitent.

Cette rubrique regroupe essentiellement des documents, liés à mes activités d’enseignement et aux réflexions qu’elles suscitent, répartis dans les sous-rubriques affichées ci-dessous. Les étudiants sont invités à consulter également l’aricle relatif au langage Scheme, qu’ils utiliseront pour leurs ED.

Les derniers articles

Avec Rust : scores de similitude d’une séquence biologique contre une banque
Publié le 25 octobre 2021
par Laurent Bloch

L’article précédent nous avait permis de lire une banque de séquences biologiques au format FASTA, en introduisant à cette occasion l’instruction (…)

Lire une banque de séquences biologiques avec Rust
Publié le 12 octobre 2021
par Laurent Bloch

Mon article précédent consacré à Rust donne une version de l’algorithme classique de Needleman et Wunsch pour l’alignement de séquences (…)

Python et Biopython
Publié le 12 octobre 2021
par Laurent Bloch
Python, Scheme, C
Publié le 12 octobre 2021
par Laurent Bloch
Une banque de séquences au format FASTA
Publié le 12 octobre 2021
par Laurent Bloch

C’est une petite banque de séquences extraites de génomes d’orchidées : >gi|2765658|emb|Z78533.1|CIZ78533 C.irapeanum 5.8S rRNA gene and ITS1 (…)

Configurer des séquences biologiques pour les aligner
Publié le 17 août 2021
par Laurent Bloch
Codage de séquences biologiques avec Rust
Publié le 17 août 2021
par Laurent Bloch
Algorithme de Needleman et Wunsch en Rust
Publié le 17 août 2021
par Laurent Bloch
Algorithme de Needleman et Wunsch en Rust
Publié le 14 août 2021
par Laurent Bloch

Sommaire Programmation dynamique Acquisition et codage des données de test Discipline de typage Calcul de la matrice des scores Et ensuite (…)

Configurer des séquences biologiques pour les aligner
Publié le 3 juillet 2021
par Laurent Bloch

Sommaire Codage, caractères, glyphes Typage et dépendances Le programme

Pour programmer un algorithme génial qui méritera le prix Turing, il (…)